Как и в первом сезоне, общая сюжетная линия является скорее фоном для творящегося на экране веселья. А штат девушек расширился на ещё одну - глупую и неуклюжую Астрею, очень напоминающую Эксель из Excel Saga.

Знакомые всем по первой части девушки - раздолбайка Юи и ее подруги по Клубу Легкой Музыки - переходят в последний класс старшей школы. Их снова ждут чаепития в клубной комнате, школьные поездки и фестивали, а на горизонте то и дело маячит выпускной – волнующее и немного печальное событие. За этой дверью во взрослую жизнь уже не будет той самой комнатки на последнем этаже школы, где девочки так любили проводить свое свободное время, не будет группы «Внеклассное Чаепитие», выступлений и просто веселой неразлучной компании. Неужели жизнь «K-On'а» закончится вместе с выпуском его участниц?